Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc39dQ0VF76 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc39dQ0VF76 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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