Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms