Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms