Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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