Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms