Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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