Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrprbP47758 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SrprbP47758 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SrprbP47758 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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SrprbP47758 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SrprbP47758 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SrprbP47758 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SrprbP47758 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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SrprbP47758 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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