Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms