Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PdgfraP26618 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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