Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
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