Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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