Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms