Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms