Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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