Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq2O09161 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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