Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna9G3X8Z7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms