Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn34dA2AGU5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn34dA2AGU5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms