Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms