Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms