Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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