Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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