Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RpainQ9CWY9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RpainQ9CWY9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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