Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl41Q9CQN7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl41Q9CQN7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms