Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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