Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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