Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hmgcll1Q8JZS7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hmgcll1Q8JZS7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hmgcll1Q8JZS7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hmgcll1Q8JZS7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hmgcll1Q8JZS7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmgcll1Q8JZS7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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