Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms