Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LnpkQ7TQ95 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LnpkQ7TQ95 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LnpkQ7TQ95 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LnpkQ7TQ95 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LnpkQ7TQ95 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms