Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Msl2Q69ZF8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Msl2Q69ZF8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Msl2Q69ZF8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Msl2Q69ZF8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Msl2Q69ZF8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Msl2Q69ZF8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms