Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1aQ61495 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1aQ61495 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms