Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms