Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb6Q60692 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms