Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh12Q5RJH3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms