Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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