Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cog7Q3UM29 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms