Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr41Q3UDP0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms