Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccbe1Q3MI99 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccbe1Q3MI99 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccbe1Q3MI99 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms