Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tmprss11cQ1JRP2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmprss11cQ1JRP2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tmprss11cQ1JRP2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Tmprss11cQ1JRP2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tmprss11cQ1JRP2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tmprss11cQ1JRP2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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