Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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NME3Q13232 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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