Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms