Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms