Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms