Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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