Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1P56183 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms