Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms