Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms