Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms