Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnd3P30282 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms