Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PparaP23204 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PparaP23204 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PparaP23204 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PparaP23204 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms