Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxb9P20615 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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